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在志愿者超级计算机团队内部'S狩猎covid线索

白宫'S团队最近增加了世界'最快的计算机到其非正式网络超过40。

世界上最快的超级计算机与白宫扩大的超级普通努力进行了努力,打击新型冠状病毒。

日本的fugaku - 哪个 超越 前500名领导美国机器 列表 六月后期的全球超级计算机加入 Covid-19高性能计算联盟。 

共同 推出 由能源部,科技政策办公室和IBM于3月下旬,财团目前促进了65多个积极研究 项目 并封装了一个巨大的超级计算机动力搜索与新的Coronavirus蔓延有关的新发现,如何有效地治疗和减轻它,更重要。数十国和国际 成员 通过努力志愿服务,提供至少485个Petaflops 容量 稳步增长,更快地为Covid-19提供新的解决方案。 

“作为一个简单的概念开始的事情已经增加到三大洲,拥有40多个超级计算机提供商,”IBM研究和联合椅总监Dario Gil,告诉 Nextgov. 上个星期。 “面对像Covid-19这样的全球大流行,希望研究人员可以驱动发现的速度是寻找治愈的关键因素,并且我们必须结合力量。“

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吉尔和其他成员和研究人员简要介绍 Nextgov. 关于这项工作如何展开,他们如何衡量成功和联盟的研究越来越受足。

联盟的演变 

能源的科学总监Chris Fall告诉了 Nextgov. 上周,自联盟以来 成立其资源已被用于分类数十亿分子以确定可以快速制造和测试效力的有希望的化合物,以靶向新型冠状病毒,从而产生大数据集以研究患者响应的变化,对新设备进行气流模拟将允许医生使用一个呼吸机来支持多名患者 - 以及更多。复杂的系统是在几天内提供计算,模拟和结果,即几个科学家所指出的是在传统计算机上需要几个月的几个月。 

“从三个月前的小谈话中,我们克服了一个无数的机构和组织边界来建立联盟,”堕落表示,补充说,“建立一个正在分享他们最好的想法的Covid-19研究人员”的努力结果了解病毒及其对人类的影响,这将是[允许]世界最终征服或限制病毒。“ 

在最近的一次采访中,能源为Paul Dabbar科学的裂缝 解释 任何对攻丝进入高级计算能力的研究员都可以通过在线向财团提交相关的研究提案 门户网站 然后将审查选择。执行委员会支持本集团的组织,并有助于转向政策,而科学委员会则任务是评估提交联盟的研究提案,以潜在对选择的影响。一旦选择,第三委员会将分配超级计算机器上的时间和周期。 

“从组织的角度来看,这真的有趣的是,它基本上是一个志愿者组织,”Dabbar指出。 

截至7月1日,联盟已收到超过148名Covid-19研究建议,通过涉及的超级计算资源,能源证实了78名Covid-19研究提案。虽然研究人员免费进入资产,但工作没有成本就没有。 Dabbar表示,Consortium Tabs进入其中一些部门的用户设施和资源,由纳税人建造和资助。努力诱导机器运行费,电力和冷却等运营成本,该达巴尔说与实际建立能力开始相对较小。“ 

“绝对成本钱,”Dabbar说。 “但在一天结束时,很多这一点正在利用美国人民投资的东西,并利用灵活性,并将其转化为此问题。”

合并的超级计算资源正在加快追逐答案和对Covid-19的解决方案,但增速速度更快并不是成功的唯一度量。 IBM的Gil在早期表示,“联盟的建立和我们在加快专家审查方面取得的效率以及超级计算制度的批准提案的快速匹配,以及迅速登机到这些系统中,必须考虑到这些系统我们的第一次重大成功。“ 

这些参与者还衡量了通过运行的上运行研究项目的数量取得成功,并强调了27个项目已经有实验,临床或政策过渡计划。内部人士还考虑到他们能够迅速汇集行业参与者,因为吉尔指出“其中许多人是竞争对手,”实验室,联邦机构,大学和几个国际合作伙伴,以分享其系统成为“主要成就”。 

美国宇航局是一名财团成员,这是从NASA先进超级普通人的首席OSTP,Piyush Mehrotra邀请时从一开始就涉及主动权,或者NAS部门 Nextgov. Thursday. 

该司在硅谷的Ames Research Center主办了空间机构的超级计算机,Mehrotra指出通常用于支持NASA航空航天,地球科学,空间科学和太空勘探任务的大规模模拟。但是,该机构的超级计算机超级资产的选择也被保留用于超越原子能机构范围的国家优先事项。  

“为了了解Covid-19,并开发治疗和疫苗,在复杂的地区等流行病学和分子建模研究中需要进行广泛的研究,这些研究可以通过超级计算资源显着加速,”Mehrotra解释说。 “因此,我们正在为研究人员提供对Covid-19回复的研究人员提供的全部储备部分,以及为港口提供我们的专业知识和支持,并在美国宇航局系统上运行其应用。”

Amazon Web Services是另一个联盟的第一波成员中加入的另一波峰,并参加了在3月份出现的概念的白宫最初的圆桌会议上讨论。该公司公共政策副总裁Shannon Kellogg告诉了 Nextgov. 在可能的情况下,在加入时,AWS“看到了一个明确的机会,以带来云的好处......在竞争中忍受治疗和疫苗。”该公司自提供云计算资源为十多次的联盟的积极项目,根据Kellogg提供“对研究团队的实物信用,为他们提供云计算资源。”然后,Tech-Giant的团队定期与研究人员一起沟通,以帮助解决技术问题。

“这项努力表明,政府,商业和学术界领导人的合作和承诺如何赋予研究人员并加快工作步伐,”凯洛格说。 

IBM,NASA和AWS之外,财团其他早期成员包括Google Cloud,Microsoft,Microsoft,MicroseSetts技术研究所,Rensselaer理工学院,国家科学基金会,以及Argonne,Lawrence Livermore,Los Alamos,Oak Ridge和Sandia国家实验室。随着财团的进展,它也是 扩展 一路上。 4月,国家大气研究中心的Wyoming超级计算中心,芯片制造商AMD和图形加工单位 - 制造商NVIDIA加入了其他。 

据珍妮特Morss,高级顾问,高性能计算,戴尔技术还开始参加4月的过程。投入成果的参与需要一个月,该公司现已从Zenith超级计算机和其他资源捐赠周期。

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